La medida fue anunciada en un comunicado del Vaticano el jueves después de que la revista francesa Le Point dio la noticia de la relación el 22 de noviembre.
Aupetit también emitió un comunicado después de que el Vaticano anunciara su decisión.
«Por supuesto, estaba muy perturbado por los ataques a los que fui sometido», se lee en el comunicado.
“Pido perdón a aquellos a quienes pude haber lastimado y les aseguro toda mi profunda amistad y mi oración, que siempre será suya”.
La supuesta relación salió a la luz debido a un correo electrónico de amor que Aupetit envió a su secretaria por error en 2012, cuando era Vicario General de París, según Le Point.
A pesar de admitir en el artículo de Le Point que su comportamiento «hacia ella puede haber sido ambiguo, lo que implica la existencia entre nosotros de una relación íntima y una relación sexual», Aupetit ha negado firmemente que algo haya sucedido realmente entre él y la mujer en cuestión.
«Aquellos que me conocieron entonces, y que compartieron mi vida diaria, ciertamente podrían testificar que no estaba manteniendo una doble vida como sugiere el artículo», dijo en una entrevista con Radio Notre Dame el 27 de noviembre.
“Reconozco, como ya he dicho, que manejé mal una situación con una persona que vino a mí en numerosas ocasiones. Confié este error a mi guía espiritual y la autoridad eclesiástica fue informada”.
La renuncia de Aupetit se produce en un momento en que la imagen pública de la Iglesia católica francesa se ha visto dañada por la publicación de un informe condenatorio en octubre que dice que miembros del clero católico en Francia abusaron sexualmente de unos 216.000 menores durante las últimas siete décadas.
El número de menores abusados se eleva a un estimado de 330.000 cuando se incluyen víctimas de personas que no eran clérigos pero que tenían otros vínculos con la Iglesia, como escuelas católicas y programas para jóvenes.
La Iglesia católica francesa ha sugerido que venderá las propiedades de la iglesia para financiar la compensación a las víctimas de abuso sexual.
Aupetit no está acusada de abusar sexualmente de niños.
En el mismo comunicado que anunciaba la renuncia de Aupetit, el Vaticano nombró a Mons. Georges Pontier como su sucesor.
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